Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms