Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gnpda1O88958 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gnpda1O88958 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gnpda1O88958 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gnpda1O88958 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gnpda1O88958 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gnpda1O88958 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gnpda1O88958 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gnpda1O88958 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gnpda1O88958 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gnpda1O88958 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gnpda1O88958 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gnpda1O88958 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gnpda1O88958 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gnpda1O88958 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gnpda1O88958 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gnpda1O88958 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gnpda1O88958 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gnpda1O88958 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gnpda1O88958 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gnpda1O88958 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gnpda1O88958 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gnpda1O88958 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gnpda1O88958 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gnpda1O88958 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gnpda1O88958 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gnpda1O88958 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gnpda1O88958 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gnpda1O88958 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms