Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Apaf1O88879 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Apaf1O88879 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms