Protein–RNA interactions for Protein: O88561

Slc27a3, Long-chain fatty acid transport protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a3O88561 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc27a3O88561 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc27a3O88561 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms