Protein–RNA interactions for Protein: O88253

Gm10226, Mszf39 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10226O88253 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10226O88253 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10226O88253 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10226O88253 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10226O88253 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10226O88253 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10226O88253 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm10226O88253 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10226O88253 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10226O88253 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10226O88253 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10226O88253 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10226O88253 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10226O88253 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10226O88253 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm10226O88253 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10226O88253 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10226O88253 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10226O88253 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10226O88253 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10226O88253 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10226O88253 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10226O88253 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms