Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SfnO70456 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SfnO70456 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SfnO70456 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SfnO70456 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SfnO70456 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SfnO70456 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SfnO70456 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SfnO70456 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SfnO70456 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SfnO70456 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SfnO70456 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SfnO70456 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SfnO70456 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SfnO70456 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SfnO70456 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SfnO70456 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SfnO70456 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SfnO70456 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SfnO70456 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SfnO70456 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SfnO70456 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SfnO70456 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SfnO70456 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SfnO70456 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SfnO70456 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SfnO70456 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SfnO70456 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SfnO70456 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SfnO70456 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SfnO70456 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SfnO70456 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SfnO70456 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SfnO70456 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SfnO70456 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SfnO70456 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SfnO70456 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SfnO70456 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SfnO70456 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SfnO70456 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SfnO70456 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SfnO70456 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SfnO70456 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SfnO70456 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SfnO70456 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SfnO70456 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SfnO70456 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SfnO70456 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SfnO70456 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SfnO70456 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SfnO70456 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SfnO70456 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SfnO70456 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SfnO70456 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SfnO70456 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SfnO70456 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SfnO70456 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SfnO70456 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SfnO70456 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SfnO70456 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SfnO70456 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SfnO70456 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SfnO70456 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SfnO70456 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SfnO70456 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SfnO70456 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SfnO70456 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SfnO70456 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SfnO70456 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SfnO70456 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SfnO70456 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SfnO70456 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SfnO70456 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SfnO70456 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SfnO70456 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SfnO70456 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SfnO70456 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SfnO70456 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SfnO70456 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SfnO70456 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SfnO70456 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SfnO70456 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SfnO70456 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SfnO70456 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SfnO70456 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SfnO70456 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SfnO70456 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SfnO70456 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SfnO70456 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SfnO70456 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SfnO70456 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SfnO70456 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SfnO70456 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SfnO70456 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SfnO70456 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SfnO70456 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SfnO70456 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SfnO70456 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SfnO70456 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SfnO70456 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms