Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nptx2O70340 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nptx2O70340 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nptx2O70340 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nptx2O70340 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nptx2O70340 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nptx2O70340 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nptx2O70340 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nptx2O70340 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nptx2O70340 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nptx2O70340 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nptx2O70340 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nptx2O70340 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nptx2O70340 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nptx2O70340 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nptx2O70340 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nptx2O70340 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms