Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lnx1O70263 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Lnx1O70263 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms