Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nipsnap2O55126 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap2O55126 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms