Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Copb2O55029 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Copb2O55029 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Copb2O55029 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Copb2O55029 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Copb2O55029 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copb2O55029 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copb2O55029 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copb2O55029 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copb2O55029 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Copb2O55029 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Copb2O55029 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Copb2O55029 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms