Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnk2O54967 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnk2O54967 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnk2O54967 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnk2O54967 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnk2O54967 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnk2O54967 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnk2O54967 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnk2O54967 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms