Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TsksO54887 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TsksO54887 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TsksO54887 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TsksO54887 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TsksO54887 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TsksO54887 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TsksO54887 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TsksO54887 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TsksO54887 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TsksO54887 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TsksO54887 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TsksO54887 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TsksO54887 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TsksO54887 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TsksO54887 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TsksO54887 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TsksO54887 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TsksO54887 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TsksO54887 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TsksO54887 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TsksO54887 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TsksO54887 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TsksO54887 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TsksO54887 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TsksO54887 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TsksO54887 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TsksO54887 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TsksO54887 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TsksO54887 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TsksO54887 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TsksO54887 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TsksO54887 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TsksO54887 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TsksO54887 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TsksO54887 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TsksO54887 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TsksO54887 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TsksO54887 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TsksO54887 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TsksO54887 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TsksO54887 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TsksO54887 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TsksO54887 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TsksO54887 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TsksO54887 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TsksO54887 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TsksO54887 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TsksO54887 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TsksO54887 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TsksO54887 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TsksO54887 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TsksO54887 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TsksO54887 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TsksO54887 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TsksO54887 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TsksO54887 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TsksO54887 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TsksO54887 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TsksO54887 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TsksO54887 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TsksO54887 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TsksO54887 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TsksO54887 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TsksO54887 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TsksO54887 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TsksO54887 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TsksO54887 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TsksO54887 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TsksO54887 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TsksO54887 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TsksO54887 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TsksO54887 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TsksO54887 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TsksO54887 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TsksO54887 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TsksO54887 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TsksO54887 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TsksO54887 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TsksO54887 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TsksO54887 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TsksO54887 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TsksO54887 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TsksO54887 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TsksO54887 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TsksO54887 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TsksO54887 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TsksO54887 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TsksO54887 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TsksO54887 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TsksO54887 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TsksO54887 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TsksO54887 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TsksO54887 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TsksO54887 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TsksO54887 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TsksO54887 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TsksO54887 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TsksO54887 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TsksO54887 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms