Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csnk2a2O54833 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk2a2O54833 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms