Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr6O54689 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms