Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab33bO35963 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms