Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf9O35739 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf9O35739 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf9O35739 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf9O35739 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf9O35739 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf9O35739 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf9O35739 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf9O35739 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf9O35739 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms