Protein–RNA interactions for Protein: O35738

Klf12, Krueppel-like factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf12O35738 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf12O35738 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf12O35738 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf12O35738 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf12O35738 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf12O35738 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf12O35738 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf12O35738 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms