Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stag2O35638 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stag2O35638 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stag2O35638 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stag2O35638 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stag2O35638 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stag2O35638 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stag2O35638 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stag2O35638 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stag2O35638 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stag2O35638 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stag2O35638 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stag2O35638 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Stag2O35638 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Stag2O35638 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Stag2O35638 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stag2O35638 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms