Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clk2O35491 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clk2O35491 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clk2O35491 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clk2O35491 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clk2O35491 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clk2O35491 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clk2O35491 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clk2O35491 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clk2O35491 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clk2O35491 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clk2O35491 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Clk2O35491 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clk2O35491 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clk2O35491 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clk2O35491 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Clk2O35491 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Clk2O35491 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Clk2O35491 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clk2O35491 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Clk2O35491 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clk2O35491 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Clk2O35491 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clk2O35491 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clk2O35491 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Clk2O35491 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Clk2O35491 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Clk2O35491 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Clk2O35491 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clk2O35491 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clk2O35491 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clk2O35491 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Clk2O35491 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clk2O35491 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clk2O35491 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clk2O35491 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clk2O35491 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Clk2O35491 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clk2O35491 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clk2O35491 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clk2O35491 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clk2O35491 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clk2O35491 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clk2O35491 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Clk2O35491 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Clk2O35491 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clk2O35491 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clk2O35491 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clk2O35491 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clk2O35491 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clk2O35491 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clk2O35491 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Clk2O35491 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clk2O35491 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clk2O35491 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clk2O35491 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clk2O35491 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Clk2O35491 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Clk2O35491 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Clk2O35491 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Clk2O35491 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clk2O35491 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms