Protein–RNA interactions for Protein: O35473

C1d, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1dO35473 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1dO35473 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1dO35473 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1dO35473 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1dO35473 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1dO35473 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1dO35473 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1dO35473 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1dO35473 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1dO35473 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1dO35473 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C1dO35473 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1dO35473 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1dO35473 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1dO35473 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1dO35473 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1dO35473 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C1dO35473 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
C1dO35473 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C1dO35473 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1dO35473 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1dO35473 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1dO35473 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1dO35473 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1dO35473 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1dO35473 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C1dO35473 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1dO35473 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1dO35473 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1dO35473 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1dO35473 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1dO35473 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1dO35473 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1dO35473 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1dO35473 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C1dO35473 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1dO35473 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1dO35473 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1dO35473 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1dO35473 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1dO35473 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1dO35473 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1dO35473 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1dO35473 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1dO35473 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1dO35473 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1dO35473 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1dO35473 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1dO35473 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1dO35473 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1dO35473 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1dO35473 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1dO35473 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1dO35473 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1dO35473 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1dO35473 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1dO35473 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1dO35473 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1dO35473 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1dO35473 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1dO35473 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1dO35473 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1dO35473 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1dO35473 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1dO35473 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1dO35473 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1dO35473 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1dO35473 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1dO35473 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1dO35473 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1dO35473 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1dO35473 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1dO35473 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C1dO35473 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1dO35473 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C1dO35473 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1dO35473 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1dO35473 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1dO35473 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1dO35473 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C1dO35473 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C1dO35473 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C1dO35473 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C1dO35473 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C1dO35473 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C1dO35473 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1dO35473 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1dO35473 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1dO35473 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1dO35473 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1dO35473 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1dO35473 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1dO35473 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1dO35473 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1dO35473 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1dO35473 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1dO35473 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1dO35473 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1dO35473 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1dO35473 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms