Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms