Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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TnxbO35452 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TnxbO35452 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TnxbO35452 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TnxbO35452 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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TnxbO35452 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TnxbO35452 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TnxbO35452 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TnxbO35452 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TnxbO35452 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TnxbO35452 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TnxbO35452 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TnxbO35452 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TnxbO35452 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TnxbO35452 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TnxbO35452 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TnxbO35452 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TnxbO35452 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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TnxbO35452 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TnxbO35452 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TnxbO35452 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TnxbO35452 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TnxbO35452 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TnxbO35452 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TnxbO35452 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TnxbO35452 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TnxbO35452 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TnxbO35452 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TnxbO35452 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TnxbO35452 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TnxbO35452 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TnxbO35452 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TnxbO35452 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TnxbO35452 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TnxbO35452 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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TnxbO35452 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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TnxbO35452 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TnxbO35452 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TnxbO35452 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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TnxbO35452 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TnxbO35452 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TnxbO35452 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TnxbO35452 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TnxbO35452 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TnxbO35452 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TnxbO35452 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TnxbO35452 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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TnxbO35452 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TnxbO35452 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TnxbO35452 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TnxbO35452 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TnxbO35452 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TnxbO35452 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TnxbO35452 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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TnxbO35452 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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TnxbO35452 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TnxbO35452 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TnxbO35452 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TnxbO35452 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TnxbO35452 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TnxbO35452 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TnxbO35452 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TnxbO35452 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TnxbO35452 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TnxbO35452 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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TnxbO35452 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TnxbO35452 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TnxbO35452 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TnxbO35452 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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TnxbO35452 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TnxbO35452 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TnxbO35452 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TnxbO35452 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TnxbO35452 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TnxbO35452 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TnxbO35452 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TnxbO35452 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TnxbO35452 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TnxbO35452 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TnxbO35452 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TnxbO35452 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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