Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms