Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kpna3O35344 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kpna3O35344 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms