Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn9O35239 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Ptpn9O35239 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn9O35239 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn9O35239 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn9O35239 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn9O35239 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn9O35239 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn9O35239 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn9O35239 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms