Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
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Nedd9O35177 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Nedd9O35177 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Nedd9O35177 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
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Nedd9O35177 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nedd9O35177 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nedd9O35177 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Nedd9O35177 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nedd9O35177 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nedd9O35177 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nedd9O35177 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nedd9O35177 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nedd9O35177 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nedd9O35177 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nedd9O35177 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Nedd9O35177 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Nedd9O35177 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Nedd9O35177 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nedd9O35177 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Nedd9O35177 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nedd9O35177 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nedd9O35177 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nedd9O35177 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nedd9O35177 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nedd9O35177 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Nedd9O35177 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
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Nedd9O35177 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nedd9O35177 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nedd9O35177 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nedd9O35177 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nedd9O35177 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nedd9O35177 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nedd9O35177 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nedd9O35177 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nedd9O35177 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nedd9O35177 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nedd9O35177 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nedd9O35177 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nedd9O35177 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nedd9O35177 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nedd9O35177 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nedd9O35177 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nedd9O35177 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nedd9O35177 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Nedd9O35177 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
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