Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Polr1aO35134 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Polr1aO35134 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Polr1aO35134 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Polr1aO35134 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Polr1aO35134 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Polr1aO35134 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Polr1aO35134 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Polr1aO35134 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Polr1aO35134 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Polr1aO35134 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Polr1aO35134 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Polr1aO35134 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Polr1aO35134 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Polr1aO35134 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Polr1aO35134 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Polr1aO35134 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Polr1aO35134 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Polr1aO35134 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Polr1aO35134 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Polr1aO35134 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Polr1aO35134 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Polr1aO35134 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Polr1aO35134 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Polr1aO35134 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Polr1aO35134 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Polr1aO35134 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Polr1aO35134 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Polr1aO35134 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Polr1aO35134 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Polr1aO35134 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Polr1aO35134 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Polr1aO35134 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Polr1aO35134 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Polr1aO35134 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Polr1aO35134 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Polr1aO35134 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Polr1aO35134 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Polr1aO35134 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Polr1aO35134 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Polr1aO35134 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Polr1aO35134 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Polr1aO35134 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Polr1aO35134 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Polr1aO35134 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Polr1aO35134 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Polr1aO35134 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Polr1aO35134 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Polr1aO35134 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Polr1aO35134 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Polr1aO35134 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Polr1aO35134 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Polr1aO35134 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Polr1aO35134 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Polr1aO35134 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms