Protein–RNA interactions for Protein: O08917

Flot1, Flotillin-1, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flot1O08917 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Flot1O08917 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Flot1O08917 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Flot1O08917 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Flot1O08917 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Flot1O08917 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Flot1O08917 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Flot1O08917 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Flot1O08917 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Flot1O08917 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Flot1O08917 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Flot1O08917 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Flot1O08917 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Flot1O08917 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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