Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PrkcshO08795 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkcshO08795 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms