Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfil3O08750 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nfil3O08750 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms