Protein–RNA interactions for Protein: O08736

Casp12, Caspase-12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp12O08736 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casp12O08736 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casp12O08736 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casp12O08736 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casp12O08736 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casp12O08736 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casp12O08736 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp12O08736 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp12O08736 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp12O08736 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms