Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Barx2O08686 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Barx2O08686 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Barx2O08686 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Barx2O08686 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Barx2O08686 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Barx2O08686 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Barx2O08686 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Barx2O08686 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Barx2O08686 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Barx2O08686 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Barx2O08686 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Barx2O08686 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Barx2O08686 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Barx2O08686 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Barx2O08686 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Barx2O08686 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms