Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
U90926O08546 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
U90926O08546 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
U90926O08546 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
U90926O08546 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
U90926O08546 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
U90926O08546 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
U90926O08546 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
U90926O08546 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
U90926O08546 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
U90926O08546 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
U90926O08546 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
U90926O08546 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
U90926O08546 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
U90926O08546 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
U90926O08546 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
U90926O08546 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
U90926O08546 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
U90926O08546 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
U90926O08546 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
U90926O08546 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
U90926O08546 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
U90926O08546 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
U90926O08546 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
U90926O08546 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
U90926O08546 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
U90926O08546 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
U90926O08546 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
U90926O08546 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
U90926O08546 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
U90926O08546 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
U90926O08546 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
U90926O08546 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
U90926O08546 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
U90926O08546 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
U90926O08546 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
U90926O08546 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
U90926O08546 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
U90926O08546 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
U90926O08546 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
U90926O08546 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
U90926O08546 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
U90926O08546 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
U90926O08546 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
U90926O08546 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
U90926O08546 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
U90926O08546 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
U90926O08546 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
U90926O08546 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
U90926O08546 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
U90926O08546 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
U90926O08546 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
U90926O08546 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
U90926O08546 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
U90926O08546 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
U90926O08546 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
U90926O08546 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
U90926O08546 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
U90926O08546 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
U90926O08546 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
U90926O08546 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
U90926O08546 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
U90926O08546 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
U90926O08546 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
U90926O08546 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
U90926O08546 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
U90926O08546 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
U90926O08546 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
U90926O08546 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
U90926O08546 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
U90926O08546 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
U90926O08546 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
U90926O08546 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
U90926O08546 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
U90926O08546 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
U90926O08546 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
U90926O08546 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
U90926O08546 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
U90926O08546 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
U90926O08546 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
U90926O08546 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
U90926O08546 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
U90926O08546 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
U90926O08546 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
U90926O08546 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
U90926O08546 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
U90926O08546 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
U90926O08546 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
U90926O08546 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
U90926O08546 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
U90926O08546 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
U90926O08546 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
U90926O08546 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
U90926O08546 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
U90926O08546 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
U90926O08546 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
U90926O08546 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
U90926O08546 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
U90926O08546 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
U90926O08546 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms