Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3239L7N2D9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3239L7N2D9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3239L7N2D9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3239L7N2D9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3239L7N2D9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3239L7N2D9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3239L7N2D9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3239L7N2D9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3239L7N2D9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3239L7N2D9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3239L7N2D9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3239L7N2D9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3239L7N2D9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3239L7N2D9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3239L7N2D9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3239L7N2D9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3239L7N2D9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3239L7N2D9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3239L7N2D9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3239L7N2D9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3239L7N2D9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3239L7N2D9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3239L7N2D9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3239L7N2D9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3239L7N2D9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3239L7N2D9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3239L7N2D9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3239L7N2D9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms