Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6871L7N248 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6871L7N248 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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