Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm20939L7N243 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20939L7N243 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20939L7N243 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms