Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccer2J3QPU5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccer2J3QPU5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccer2J3QPU5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccer2J3QPU5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccer2J3QPU5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccer2J3QPU5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccer2J3QPU5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccer2J3QPU5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccer2J3QPU5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccer2J3QPU5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccer2J3QPU5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccer2J3QPU5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccer2J3QPU5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccer2J3QPU5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccer2J3QPU5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccer2J3QPU5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccer2J3QPU5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccer2J3QPU5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccer2J3QPU5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccer2J3QPU5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccer2J3QPU5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccer2J3QPU5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccer2J3QPU5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccer2J3QPU5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccer2J3QPU5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccer2J3QPU5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccer2J3QPU5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccer2J3QPU5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccer2J3QPU5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccer2J3QPU5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccer2J3QPU5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccer2J3QPU5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccer2J3QPU5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccer2J3QPU5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccer2J3QPU5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccer2J3QPU5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccer2J3QPU5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccer2J3QPU5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccer2J3QPU5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccer2J3QPU5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccer2J3QPU5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccer2J3QPU5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccer2J3QPU5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms