Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20834J3QM72 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20834J3QM72 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20834J3QM72 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20834J3QM72 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20834J3QM72 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20834J3QM72 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20834J3QM72 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20834J3QM72 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20834J3QM72 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20834J3QM72 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20834J3QM72 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20834J3QM72 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20834J3QM72 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20834J3QM72 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20834J3QM72 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20834J3QM72 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20834J3QM72 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20834J3QM72 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20834J3QM72 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20834J3QM72 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20834J3QM72 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20834J3QM72 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20834J3QM72 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20834J3QM72 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20834J3QM72 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20834J3QM72 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20834J3QM72 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20834J3QM72 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20834J3QM72 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20834J3QM72 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20834J3QM72 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20834J3QM72 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20834J3QM72 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20834J3QM72 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20834J3QM72 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20834J3QM72 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20834J3QM72 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20834J3QM72 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20834J3QM72 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20834J3QM72 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20834J3QM72 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms