Protein–RNA interactions for Protein: J3QJZ1

Gm21969, Predicted gene 21969, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21969J3QJZ1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm21969J3QJZ1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm21969J3QJZ1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21969J3QJZ1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms