Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21060J3KMU4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21060J3KMU4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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