Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AK157302I3ITR1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
AK157302I3ITR1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AK157302I3ITR1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AK157302I3ITR1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AK157302I3ITR1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AK157302I3ITR1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AK157302I3ITR1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AK157302I3ITR1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AK157302I3ITR1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AK157302I3ITR1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AK157302I3ITR1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AK157302I3ITR1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AK157302I3ITR1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AK157302I3ITR1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AK157302I3ITR1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AK157302I3ITR1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AK157302I3ITR1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
AK157302I3ITR1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AK157302I3ITR1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AK157302I3ITR1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AK157302I3ITR1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AK157302I3ITR1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AK157302I3ITR1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AK157302I3ITR1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AK157302I3ITR1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AK157302I3ITR1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AK157302I3ITR1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
AK157302I3ITR1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AK157302I3ITR1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AK157302I3ITR1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AK157302I3ITR1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms