Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G2

Usp17ld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein D, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17ldG5E8G2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp17ldG5E8G2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp17ldG5E8G2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp17ldG5E8G2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp17ldG5E8G2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp17ldG5E8G2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp17ldG5E8G2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp17ldG5E8G2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms