Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.2 ms