Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn34aG3UW52 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn34aG3UW52 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms