Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
5830473C10RikF8VQ07 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms