Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ercc6F8VPZ5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ercc6F8VPZ5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ercc6F8VPZ5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Ercc6F8VPZ5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ercc6F8VPZ5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Ercc6F8VPZ5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ercc6F8VPZ5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ercc6F8VPZ5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ercc6F8VPZ5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ercc6F8VPZ5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ercc6F8VPZ5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ercc6F8VPZ5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Ercc6F8VPZ5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms