Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-M1F7CXU4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M1F7CXU4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms