Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

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Length 94 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3443F7CCV5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3443F7CCV5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3443F7CCV5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3443F7CCV5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3443F7CCV5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3443F7CCV5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3443F7CCV5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3443F7CCV5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3443F7CCV5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3443F7CCV5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3443F7CCV5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3443F7CCV5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3443F7CCV5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3443F7CCV5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3443F7CCV5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3443F7CCV5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3443F7CCV5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3443F7CCV5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3443F7CCV5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3443F7CCV5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3443F7CCV5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3443F7CCV5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3443F7CCV5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3443F7CCV5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3443F7CCV5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3443F7CCV5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3443F7CCV5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3443F7CCV5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3443F7CCV5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3443F7CCV5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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