Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
D430041D05RikF6ZGR6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
D430041D05RikF6ZGR6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
D430041D05RikF6ZGR6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
D430041D05RikF6ZGR6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
D430041D05RikF6ZGR6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
D430041D05RikF6ZGR6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
D430041D05RikF6ZGR6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
D430041D05RikF6ZGR6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
D430041D05RikF6ZGR6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
D430041D05RikF6ZGR6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
D430041D05RikF6ZGR6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
D430041D05RikF6ZGR6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
D430041D05RikF6ZGR6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
D430041D05RikF6ZGR6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
D430041D05RikF6ZGR6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
D430041D05RikF6ZGR6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
D430041D05RikF6ZGR6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
D430041D05RikF6ZGR6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
D430041D05RikF6ZGR6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
D430041D05RikF6ZGR6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
D430041D05RikF6ZGR6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
D430041D05RikF6ZGR6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
D430041D05RikF6ZGR6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
D430041D05RikF6ZGR6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
D430041D05RikF6ZGR6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
D430041D05RikF6ZGR6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
D430041D05RikF6ZGR6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
D430041D05RikF6ZGR6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
D430041D05RikF6ZGR6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
D430041D05RikF6ZGR6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
D430041D05RikF6ZGR6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
D430041D05RikF6ZGR6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
D430041D05RikF6ZGR6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
D430041D05RikF6ZGR6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
D430041D05RikF6ZGR6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
D430041D05RikF6ZGR6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
D430041D05RikF6ZGR6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
D430041D05RikF6ZGR6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
D430041D05RikF6ZGR6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
D430041D05RikF6ZGR6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms