Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Igkv1-99F6XWB2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Igkv1-99F6XWB2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Igkv1-99F6XWB2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Igkv1-99F6XWB2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Igkv1-99F6XWB2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Igkv1-99F6XWB2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Igkv1-99F6XWB2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Igkv1-99F6XWB2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Igkv1-99F6XWB2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Igkv1-99F6XWB2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Igkv1-99F6XWB2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Igkv1-99F6XWB2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Igkv1-99F6XWB2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Igkv1-99F6XWB2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Igkv1-99F6XWB2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Igkv1-99F6XWB2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Igkv1-99F6XWB2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Igkv1-99F6XWB2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Igkv1-99F6XWB2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Igkv1-99F6XWB2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Igkv1-99F6XWB2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Igkv1-99F6XWB2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Igkv1-99F6XWB2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Igkv1-99F6XWB2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Igkv1-99F6XWB2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Igkv1-99F6XWB2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Igkv1-99F6XWB2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Igkv1-99F6XWB2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Igkv1-99F6XWB2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Igkv1-99F6XWB2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Igkv1-99F6XWB2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Igkv1-99F6XWB2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Igkv1-99F6XWB2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Igkv1-99F6XWB2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Igkv1-99F6XWB2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Igkv1-99F6XWB2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Igkv1-99F6XWB2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Igkv1-99F6XWB2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Igkv1-99F6XWB2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms